Bio/chemoinformatik

O skupině

Skupina biochemické farmakologie je servisní jednotkou (Core Facility) podporující vědce z ÚOCHB především (ale nejen) v časných fázích vývoje potenciálních léčiv.  Specializujeme se na vývoj testů, biologický screening, validaci cílových struktur a ADME charakterizaci látek, přičemž naše aktivní projekty pokrývají oblasti onkologie, antiinfektiv a neurofarmakologie.

Díky rozšiřujícím se možnostem v oblasti miniaturizace testů, automatizace a formátů bohatých na data se dostáváme do bodu, kdy potřebujeme systémovou i operativní pomoc při zpracovávání dat (vyhodnocování, reporting).

Vaše role a profil

Hledáme specialistu na bio/chemoinformatiku, který bude podporovat naše projekty prostřednictvím skriptování a programování, zpracování dat a integrace systémů. Kromě práce pro výzkumný tým bude kandidát úzce spolupracovat také s týmem datového managementu ústavu (data steward, data koordinátor) při nastavování a rozvoji procesů správy a integrace dat.

Očekáváme

• skriptování/programování v jazyce Python a R
• schopnost transformovat skripty do podoby webových aplikací (Flask, Vue) a jejich nasazování přes Docker
• zkušenosti s databázemi (PostgreSQL)
• integrace systémů přes REST API, např. propojení na elektronické laboratorní deníky (ELN)
• proaktivní a systematický přístup, schopnost pracovat samostatně i v týmu a ochotu pomáhat při automatizaci procesů
• základní znalost práce a údržby datových úložišť (NAS, Synology, S3) – výhodou
• znalost softwaru KNIME Analytics Platform a práce s ním – výhodou
• zkušenost s prací v laboratoři biologického směru a ochota zapojit se do laboratorní práce – výhodou

Nabízíme

• práci v odborně stimulujícím prostředí
• možnost profesního růstu a dalšího vzdělávání
• zázemí špičkové výzkumné instituce
• přátelskou a kolegiální atmosféru
• jedinečnou příležitost podílet se na modernizaci procesů v oblasti nakládání s daty
• 5 týdnů dovolené + 4 dny osobního volna
• finanční podpora pro rodiče s dětmi do 4 let věku, kteří se vrací po mateřské / rodičovské dovolené
• zaměstnanecké benefity (příspěvek na stravování, restaurace v budově ÚOCHB, příspěvek na penzijní připojištění / volnočasové aktivity, Multisport karta, zvýhodněné jazykové vzdělávání)

Dodatečné informace:

• zaměstnání na plný úvazek
• pracovní poměr na 1 rok s možnosti prodloužení
• nástup k 1. 1. 2026, případně i dříve

 Jak se přihlásit:

• strukturovaný životopis a motivační dopis zašlete dr. Heleně Mertlíkové Kaiserové na email: kaiserova@uochb.cas.cz
• došlé přihlášky budeme přijímat a vyhodnocovat, dokud nebude pozice obsazena

Pozn.: Mužský rod v textu používáme jen pro jazykové zjednodušení — vítáme kohokoli, kdo se v popisu role našel.

Zdroj: ÚOCHB